黄连上清片具有抑制炎症反应和抑菌的作用，也可以把它当做中药消炎药。临床上常用于治疗急性结膜炎、急性化脓性中耳炎、复发性口腔溃疡、急性牙周（龈）炎、急性咽喉炎等。