目前，国家发改委正在酝酿出台措施，对属于企业自主定价的药品，加强市场购销价格调查；对政府指导价药品加强成本审核，建立基本药物动态调整机制，研究改进药品价格管理方法。但有专家质疑，改革定价机制之所以困难重重，根源在于政府很难得到真实的出厂价和流通差价。一是药品生产企业数量庞大，尤其是企业自行报送的成本价格很可能只是虚开的高价。二是不少新药、高价药都是进口、合资企业的产品，政府监管起来难度更大。
药品流通难挡雁过拔毛
流通环节的层层加价，是造成药价飞涨的另一个重要原因。据陕西省有关部门测算，药品出厂后经过多级批发，进入二级以上医院一般需要3到4个环节，而进入农村基层医疗机构要经过的环节更多。每个环节至少要加价8%，这就造成了农村用药价格高于城市、基层医院用药价格高于大医院的现象。
中信证券研究部一位资深分析师认为，药品流通产业链的异动，源于目前畸形的医疗体制和监管体制。一是大型公立医院处在非常强势的地位，中间环节自然就少。二是很多居间人或代理商掌握了较固定的药品销售渠道和药品来源，他们控制了部分良好的医院终端资源。即使是一些大型医药流通企业，要拓展外地市场，也必须部分地依赖于居间人的区域优势。三是在医药流通渠道上，存在税务、工商、药监等部门多头监管的问题。
为了压缩药品流通环节，陕西省通过在全国药品生产企业中统一招标采购、乡镇卫生院和社区卫生服务中心统一药品销售价格、由公开选招的企业统一配送的"三统一"办法，推进基本药物制度的实施。
对于"三统一"办法，宁波长富药业有限公司一位工作人员认为，企业的生产成本不同，同价销售可能造成竞标企业为追求低成本而不规范生产，进而引发无序竞争的恶性循环。半月谈记者调查发现，目前很多省份都在尝试药品的统一采购，但跨区域经营的企业在统一采购上的比例还不高。专家分析认为，品牌药企出于谈判能力的考虑，更多地会寻找区域分销的商业公司来竞标，而区域性招投标政策在一定程度上阻碍了统一采购的实行。
2009年，国家下发了进一步规范医疗机构药品集中采购工作的意见，规定原则上只允许生产企业委托流通企业进行一次配送。但从我国目前医疗机构终端的分布情况、流通企业的分拣和配送能力来看，一次配送的难度很大，所以这份意见也留下了政策缺口，即"如被委托企业无法向医疗机构直接配送时，经省级药品集中采购管理部门批准，可委托其他企业配送"。
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